Si le premier seigneur de Tonquédec connu apparaît au milieu du XIIe siècle et se nomme Prigent (il marie sa fille, en 1180, à Geslin de Penthièvre, vicomte de Coëtmen ou Coatmen), la première mention du château ne date que de 1231. Son seigneur en est alors Alain de Coëtmen.

Dans le dernier quart du XIVe siècle, Olivier de Clisson, connétable de France, avec l'appui de Rolland III de Coëtmen, entre en conflit avec le duc de Bretagne Jean IV (du parti anglais). En 1395, Alain de Pierrier, maréchal de Bretagne, s'empare du château. Jean IV le fait démolir afin de rendre sa défense impossible.

En janvier 1400, Jeanne de Navarre, veuve du duc de Bretagne, signe une alliance avec les Clisson et les Penthièvre. Grâce à cet accord, Rolland III perçoit six ans plus tard 3.000 livres d'indemnités " pour cause de la démolicion de son chastel de Tronquédec ". C'est donc en 1406 qu'il entreprend la construction du nouveau château (sur un plan similaire au précédent).

A partir de 1472, son petit-fils, Jean II de Coëtmen, relance les travaux. Vont être construits, sur le front ouest dominant la vallée du Léguer, un très beau logis avec une imposante tour d'artillerie, et sur le front sud une immense barbacane.

Charles Gouyon, baron de la Moussaye et vicomte de Tonquédec, achève entre 1577 et 1582 les travaux entrepris par Jean II en améliorant l'adaptation du château à l'artillerie et en terminant la barbacane (achèvement ou remaniement ?). A la fin de cette décennie et jusqu'en 1598, le château devient un repaire protestant d'où s'organisent des raids meurtriers contre les Ligueurs.

En 1614, le baron de Marcé, frère du vicomte de Tonquédec, s'installe au château avec une poignée de soldats. Pour les neutraliser, la ville de Lannion envoie " un commando " qui s'empare de la place dans la nuit du 17 au 18 avril. Richelieu ordonnera son démantèlement en 1626.

La famille de Rougé (descendante des Coëtmen) en est propriétaire depuis 1880. Elle y a fait restaurer le donjon sud-est, dit tour d'Acigné - du nom d'un vicomte de Tonquédec, en 1496 - (mise hors d'eau, rétablissement des planchers et du sommet de la tourelle d'escalier) et le cellier du logis Jean II.